Hyödyllisiä ohjelmia

Kaikki seuraavista ohjelmista ovat ilmaisia.

Yleistyökaluja

• Weka. Helppokäyttöinen yleistyökalu. Sekä windows- että linux-versio. (mm. klusterointi- ja luokittelualgoritmeja ja joitain piirteiden eristysmenetelmiä)
• Orange Yleistyökalu datan visualisointiin ja analysointiin. (Monet kehuvat, kertokaa jos on hyvä!)
• RapidMiner Erittäin suosittu tiedonlouhintatyökalu. Erikoisuus: SVM-klusterointi. Voi yhdistää Wekaan? (Kertokaa jos hyvä!)
• Tanagra Wekan tapainen, ei mitään mitä siinä ei olisi(?). Kuulemma helppo lisätä omia menetelmiä.
• R tilastollisen laskennan ohjelmointiympäristö (löytyy paljon valmiita paketteja eri tarkoituksiin)
• Borgeltin työkaluja data-analyysiin sekä komentorivipohjaisia että erillinen graafinen käyttöliittymä. Mm. probabislitistinen klusterointi, decision and regression tree, multilayer perceptron, Bayes-luokittelijoita.
• Gnumeric Hyvä taulukkolaskentaohjelma. Sopii numeerisen datan tilastolliseen analyysiin ja yksinkertaiseen mallinnukseen (monimutkaisimpia toimintoja lienevät PCA ja monen muuttujan lineaariregressio). Sekä linux- että windows-versio.

Klusterointiohjelmia

• Klusterointityökaluja ja tarvittavia konverttereita (Laitoksen tutkijoiden koodaamia) (Voi olla hankala saada toimimaan linuxissa?)
• Cluster 3.0 erityisesti geenidatan klusterointiin tarkoitettuja algoritmeja yhdessö paketissa
• ELKI Työkalu klusterointiin ja ulkopuolisten tunnistukseen. Sis. mm. tiheysperustaisia menetelmiä
• MixModMalliperustaisia klusterointimenetelmiä. Voi käyttää Matlabista, ajaa suoraan komentoriviltä tai kutsua omista ohjelmista.

Riippuvuus- ja luokittelusääntöohjelmia

• Kingfisher 1.2 Tilastollisesti merkitsevien riippuvuussääntöjen etsintä binääridatasta erilaisilla hyvyysmitoilla. Huom! uusi versio jolle voi antaa eheysehtoja! Ohjeita muuttujien esiprosessointiin täällä.
• namescodes-apuohjelma muuntaa nominaaliattribuutit (transaktiodatassa) koodinumeroiksi ja tulostiedoston koodatut riippuvuussäännöt takaisin nominaalisiksi. (Kun attribuuteille antaa alkujaan kuvaavat nimet, säännöt ovat helposti ymmärrettäviä.)
• MagnumOpus ilmainen demoversio (max 1000-riviselle datalle). Etsii tilastollisesti päteviä assosiaatiosääntöjä eli riippuvuussääntöjä. Eri hyvyysmittoja ja hieman erilaisia hahmoja kuin Kingfisherissä
• Mutuali kahden muuttujan välisten riippuvuuksien systemaattinen haku Mutual Information-mitalla. Uusi svg-versio piirtää myös kuvat.
• Autokorrelaatiot Hyvin simppeli ohjelma vuorokausirytmin tarkistukseen tuntikohtaisesta datasta. Mukana gnuplot-skripti korrelogrammin tulostukseen.

Bayes-verkko-ohjelmia

Kattava lista ohjelmia täällä

Apuskriptejä

Muuta